Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TCOF1Q13428 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TCOF1Q13428 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
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