Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKP2Q13309 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKP2Q13309 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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