Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.18
GRIN2BQ13224 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
GRIN2BQ13224 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GRIN2BQ13224 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
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