Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX3Q13185 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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