Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHAF1AQ13111 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms