Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFX1Q12986 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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