Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF2Q12933 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAF2Q12933 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAF2Q12933 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAF2Q12933 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAF2Q12933 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF2Q12933 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms