Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
STX4Q12846 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
STX4Q12846 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
STX4Q12846 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
STX4Q12846 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STX4Q12846 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STX4Q12846 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STX4Q12846 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STX4Q12846 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STX4Q12846 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STX4Q12846 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STX4Q12846 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STX4Q12846 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
STX4Q12846 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
STX4Q12846 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STX4Q12846 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
STX4Q12846 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
STX4Q12846 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STX4Q12846 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STX4Q12846 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STX4Q12846 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STX4Q12846 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STX4Q12846 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STX4Q12846 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STX4Q12846 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STX4Q12846 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
STX4Q12846 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
STX4Q12846 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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