Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TROQ12816 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TROQ12816 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TROQ12816 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TROQ12816 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TROQ12816 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TROQ12816 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TROQ12816 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TROQ12816 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TROQ12816 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TROQ12816 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TROQ12816 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TROQ12816 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TROQ12816 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TROQ12816 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TROQ12816 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TROQ12816 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TROQ12816 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TROQ12816 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TROQ12816 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TROQ12816 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TROQ12816 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
TROQ12816 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TROQ12816 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TROQ12816 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TROQ12816 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TROQ12816 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TROQ12816 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TROQ12816 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TROQ12816 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TROQ12816 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TROQ12816 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TROQ12816 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TROQ12816 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TROQ12816 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TROQ12816 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TROQ12816 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TROQ12816 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TROQ12816 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TROQ12816 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
TROQ12816 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TROQ12816 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TROQ12816 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TROQ12816 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TROQ12816 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TROQ12816 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TROQ12816 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TROQ12816 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TROQ12816 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TROQ12816 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROQ12816 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TROQ12816 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROQ12816 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROQ12816 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROQ12816 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROQ12816 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROQ12816 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROQ12816 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TROQ12816 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROQ12816 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROQ12816 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROQ12816 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROQ12816 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROQ12816 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROQ12816 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROQ12816 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROQ12816 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TROQ12816 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TROQ12816 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TROQ12816 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TROQ12816 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TROQ12816 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TROQ12816 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TROQ12816 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TROQ12816 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
TROQ12816 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TROQ12816 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TROQ12816 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TROQ12816 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TROQ12816 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
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