Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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FOXO1Q12778 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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FOXO1Q12778 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXO1Q12778 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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FOXO1Q12778 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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FOXO1Q12778 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXO1Q12778 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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