Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 TCD1YHR003C 1290 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 EBP2YKL172W 1284 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 YLR042CYLR042C 486 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 YMR087WYMR087W 855 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 KTI11YBL071W-A 249 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 DUG3YNL191W 1074 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 LTP1YPR073C 486 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 RSM23YGL129C 1353 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 SLI1YGR212W 1407 nt2.58□□□□□ -2
MSH5Q12175 SST2YLR452C 2097 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 YPL216WYPL216W 3309 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 HMO1YDR174W 741 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 COX23YHR116W 456 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 SUB1YMR039C 879 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 MRPL33YMR286W 261 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 RPL23AYBL087C 414 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 TPT1YOL102C 693 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 YOR203WYOR203W 354 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 REG2YBR050C 1017 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 MSH4YFL003C 2637 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 KIN3YAR018C 1308 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 BCK1YJL095W 4437 nt2.57□□□□□ -2
MSH5Q12175 AIM6YDL237W 1173 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 YDR535CYDR535C 501 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 AGE2YIL044C 897 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 YIL054WYIL054W 318 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 RPA12YJR063W 378 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 THI80YOR143C 960 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 YOR387CYOR387C 621 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 ACM1YPL267W 630 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 JID1YPR061C 906 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 SPP381YBR152W 876 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 FRE8YLR047C 2061 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 YKL222CYKL222C 2118 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 FAA2YER015W 2235 nt2.56□□□□□ -2
MSH5Q12175 DTD1YDL219W 453 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 TLC1TLC1 1301 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 YGL159WYGL159W 1113 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 PRP18YGR006W 756 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 YGR293CYGR293C 462 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 IMP3YHR148W 552 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 MMF1YIL051C 438 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 YKL162CYKL162C 1209 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 SIC1YLR079W 855 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 TIF34YMR146C 1044 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 RPS10BYMR230W 318 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 snR42snR42 351 nt2.55□□□□□ -2
MSH5Q12175 TDA1YMR291W 1761 nt2.54□□□□□ -2
MSH5Q12175 ERG20YJL167W 1059 nt2.54□□□□□ -2
MSH5Q12175 ARC19YKL013C 516 nt2.54□□□□□ -2
MSH5Q12175 ERV41YML067C 1059 nt2.54□□□□□ -2
MSH5Q12175 SRL1YOR247W 633 nt2.54□□□□□ -2
MSH5Q12175 SUT2YPR009W 807 nt2.54□□□□□ -2
MSH5Q12175 DPB3YBR278W 606 nt2.54□□□□□ -2
MSH5Q12175 YBR259WYBR259W 2067 nt2.54□□□□□ -2
MSH5Q12175 POL4YCR014C 1749 nt2.54□□□□□ -2
MSH5Q12175 NAB3YPL190C 2409 nt2.53□□□□□ -2
MSH5Q12175 SLY41YOR307C 1362 nt2.53□□□□□ -2
MSH5Q12175 FMN1YDR236C 657 nt2.53□□□□□ -2
MSH5Q12175 COBQ0105 1158 nt2.53□□□□□ -2
MSH5Q12175 BAT1YHR208W 1182 nt2.53□□□□□ -2
MSH5Q12175 LAC1YKL008C 1257 nt2.53□□□□□ -2
MSH5Q12175 SMA2YML066C 1110 nt2.53□□□□□ -2
MSH5Q12175 TIM12YBR091C 330 nt2.53□□□□□ -2
MSH5Q12175 STE6YKL209C 3873 nt2.53□□□□□ -2
MSH5Q12175 ARP8YOR141C 2646 nt2.53□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 PBS2YJL128C 2007 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 STN1YDR082W 1485 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 BOI1YBL085W 2943 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 AVT2YEL064C 1443 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YNL011CYNL011C 1335 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 RPS14AYCR031C 414 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 PET100YDR079W 336 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 TCA17YEL048C 459 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SGM1YJR134C 2124 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 MST28YAR033W 705 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 CDC123YLR215C 1083 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SAS2YMR127C 1017 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 ATP3YBR039W 936 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 ISW1YBR245C 3390 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 PEX5YDR244W 1839 nt2.52□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 KHA1YJL094C 2622 nt2.51□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 snR68snR68 136 nt2.51□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 UPF3YGR072W 1164 nt2.51□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.51□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 MCR1YKL150W 909 nt2.51□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 JIP3YLR331C 378 nt2.51□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 RRD2YPL152W 1077 nt2.51□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YKU80YMR106C 1890 nt2.51□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 PSD2YGR170W 3417 nt2.51□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 SMY2YBR172C 2223 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 TOP2YNL088W 4287 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 CDC5YMR001C 2118 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 BET3YKR068C 582 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YKR070WYKR070W 1059 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 YMR187CYMR187C 1296 nt2.5□□□□□ -2.01
MSH5Q12175 CTP1YBR291C 900 nt2.5□□□□□ -2.01
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