Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 VBA4YDR119W 2307 nt3.9□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 REG1YDR028C 3045 nt3.9□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RTT109YLL002W 1311 nt3.9□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 SWH1YAR042W 3567 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 FAD1YDL045C 921 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YDL071CYDL071C 375 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 MGT1YDL200C 567 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 AIM11YER093C-A 414 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YFL015CYFL015C 495 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 SMX2YFL017W-A 234 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 EMC4YGL231C 573 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 SPT4YGR063C 309 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YGR126WYGR126W 693 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 VMA5YKL080W 1179 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RPN13YLR421C 471 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 PRM6YML047C 1059 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 MRPL16YBL038W 699 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 GIM3YNL153C 390 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 SPT10YJL127C 1923 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 SET1YHR119W 3243 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 UBP5YER144C 2418 nt3.89□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 UBP8YMR223W 1416 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 TCB3YML072C 4638 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RPN2YIL075C 2838 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RPS14AYCR031C 414 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 DTD1YDL219W 453 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RSM28YDR494W 1086 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 THO1YER063W 657 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 LIF1YGL090W 1266 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RPS23AYGR118W 438 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 VMA10YHR039C-A 345 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YPT7YML001W 627 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 VPS20YMR077C 666 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 HHF2YNL030W 312 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RPS23BYPR132W 438 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 DER1YBR201W 636 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 FUS2YMR232W 2034 nt3.88□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 QCR10YHR001W-A 234 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 BCD1YHR040W 1101 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YHR212CYHR212C 336 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 DAL2YIR029W 1032 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YKR011CYKR011C 1062 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RPL15AYLR029C 615 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YAR060CYAR060C 336 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RPL13BYMR142C 600 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 IMP1YMR150C 573 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 GCY1YOR120W 939 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 ADF1YCL058W-A 342 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 JEN1YKL217W 1851 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 AVT5YBL089W 1380 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 MRS2YOR334W 1413 nt3.87□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YCR013CYCR013C 648 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 OCA6YDR067C 675 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YIP1YGR172C 747 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 MTM1YGR257C 1101 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 AIM26YKL037W 357 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RSM19YNR037C 276 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 snR35snR35 204 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YBR259WYBR259W 2067 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 PRP22YER013W 3438 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 PEX5YDR244W 1839 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 MAK5YBR142W 2322 nt3.86□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 VAC14YLR386W 2643 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 RRN6YBL014C 2685 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 TRX3YCR083W 384 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YDL050CYDL050C 372 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 MIG3YER028C 1185 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YGL214WYGL214W 486 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YIL141WYIL141W 390 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YKL069WYKL069W 543 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 TIF4631YGR162W 2859 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 GCN5YGR252W 1320 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YLR446WYLR446W 1302 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 ELM1YKL048C 1923 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 ANR2YKL047W 1551 nt3.85□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 MSH2YOL090W 2895 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 PDS5YMR076C 3834 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 MSD1YPL104W 1977 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 FRE8YLR047C 2061 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 AAD3YCR107W 1092 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 SLD5YDR489W 885 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YGL074CYGL074C 327 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 MRM2YGL136C 963 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 COG2YGR120C 789 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YAR070CYAR070C 300 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 TUM1YOR251C 915 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 YOR283WYOR283W 693 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 GYL1YMR192W 2163 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 CTF13YMR094W 1437 nt3.84□□□□□ -1.79
SLX4Q12098 SLA1YBL007C 3735 nt3.84□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 APE2YKL157W 2859 nt3.84□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 NUP159YIL115C 4383 nt3.84□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 COP1YDL145C 3606 nt3.83□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 PEX10YDR265W 1014 nt3.83□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt3.83□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 DSE2YHR143W 978 nt3.83□□□□□ -1.8
SLX4Q12098 SOD1YJR104C 465 nt3.83□□□□□ -1.8
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