Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC15Q0P6D6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC15Q0P6D6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms