Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE4DQ08499 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms