Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL1Q08397 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LOXL1Q08397 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms