Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP3CAQ08209 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms