Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNK2Q07912 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNK2Q07912 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms