Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms