Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK18Q07002 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK18Q07002 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK18Q07002 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms