Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms