Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	RHO5	YNL180C	996 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	HHF1	YBR009C	312 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	FAS1	YKL182W	6156 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YGL176C	YGL176C	1665 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	SEC15	YGL233W	2733 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	HEH2	YDR458C	1992 nt		3.42	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	RRM3	YHR031C	2172 nt		3.41	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	FAR1	YJL157C	2493 nt		3.41	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	VPS17	YOR132W	1656 nt		3.41	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	HTB1	YDR224C	396 nt		3.41	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YGR283C	YGR283C	1026 nt		3.41	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	COX14	YML129C	213 nt		3.41	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YNL013C	YNL013C	378 nt		3.41	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		3.41	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	CHS2	YBR038W	2892 nt		3.41	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	BCH1	YMR237W	2175 nt		3.41	□□□□□ -1.86
MRD1	Q06106	snR68	snR68	136 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	AI3	Q0060	1248 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	TVP15	YDR100W	432 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	COG7	YGL005C	840 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YGR018C	YGR018C	330 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	PET54	YGR222W	882 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	TAO3	YIL129C	7131 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	SMD2	YLR275W	333 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YLR400W	YLR400W	474 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	OCA2	YNL056W	594 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YBL068W-A	YBL068W-A	237 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	LCB4	YOR171C	1875 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	HUA2	YOR284W	732 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RPS12	YOR369C	432 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	IRC3	YDR332W	2070 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	DYN1	YKR054C	12279 nt		3.4	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YOR296W	YOR296W	3870 nt		3.39	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	SMT3	YDR510W	306 nt		3.39	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	CWC23	YGL128C	852 nt		3.39	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YGR039W	YGR039W	312 nt		3.39	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YHL005C	YHL005C	393 nt		3.39	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	GPX1	YKL026C	504 nt		3.39	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	AAR2	YBL074C	1068 nt		3.39	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	FUN30	YAL019W	3396 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	STP2	YHR006W	1626 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	ARF1	YDL192W	546 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YDR442W	YDR442W	393 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	MAM1	YER106W	909 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	LIF1	YGL090W	1266 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RPS23A	YGR118W	438 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YKL065W-A	YKL065W-A	222 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RPL6A	YML073C	531 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	END3	YNL084C	1050 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	MER1	YNL210W	813 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RPS23B	YPR132W	438 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	DPB3	YBR278W	606 nt		3.38	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	APC5	YOR249C	2058 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	BEM4	YPL161C	1902 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	MFA1	YDR461W	111 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	COB	Q0105	1158 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	BRR6	YGL247W	594 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	CTK2	YJL006C	972 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RPS21B	YJL136C	264 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RPS30A	YLR287C-A	192 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	SMA2	YML066C	1110 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	MCA1	YOR197W	1299 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	JJJ1	YNL227C	1773 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	PIG2	YIL045W	1617 nt		3.37	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	DBP10	YDL031W	2988 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	NMD2	YHR077C	3270 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RIF1	YBR275C	5751 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	ATC1	YDR184C	885 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	SEC4	YFL005W	648 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RPL1B	YGL135W	654 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	IME1	YJR094C	1083 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YKL091C	YKL091C	933 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RPL1A	YPL220W	654 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RFC5	YBR087W	1065 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	VAC8	YEL013W	1737 nt		3.36	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	ERP3	YDL018C	678 nt		3.35	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RPL13A	YDL082W	600 nt		3.35	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YPD1	YDL235C	504 nt		3.35	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	MIX14	YDR031W	366 nt		3.35	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	RPA12	YJR063W	378 nt		3.35	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YPR053C	YPR053C	456 nt		3.35	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YBR300C	YBR300C	498 nt		3.35	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	TIF4631	YGR162W	2859 nt		3.35	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	BUD4	YJR092W	4344 nt		3.35	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	PHO81	YGR233C	3537 nt		3.35	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	MDM1	YML104C	3384 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YDL158C	YDL158C	309 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YGL082W	YGL082W	1146 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	UPF3	YGR072W	1164 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	SPO11	YHL022C	1197 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YIL175W	YIL175W	318 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YJL222W-B	YJL222W-B	138 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	PHD1	YKL043W	1101 nt		3.34	□□□□□ -1.87
MRD1	Q06106	YNL184C	YNL184C	327 nt		3.34	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms