Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTDSPL2Q05D32 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTDSPL2Q05D32 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms