Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EMX1Q04741 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms