Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	RED1	YLR263W	2484 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	PFK26	YIL107C	2484 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	SRB7	YDR308C	423 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	STE14	YDR410C	720 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	MFA1	YDR461W	111 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	ERP6	YGL002W	651 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YGL204C	YGL204C	306 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	ERG25	YGR060W	930 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	CMC1	YKL137W	336 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	RPN13	YLR421C	471 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YMR294W-A	YMR294W-A	360 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	TPT1	YOL102C	693 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YPR050C	YPR050C	414 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	DPB3	YBR278W	606 nt		3.46	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	LCB4	YOR171C	1875 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	DRS2	YAL026C	4068 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	snR70	snR70	164 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	RPL22B	YFL034C-A	369 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	RPC37	YKR025W	849 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	OST6	YML019W	999 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YOR097C	YOR097C	528 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	SRL1	YOR247W	633 nt		3.45	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	SRP68	YPL243W	1800 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	MDV1	YJL112W	2145 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	VTC4	YJL012C	2166 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	DIG2	YDR480W	972 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YGR053C	YGR053C	852 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	COX3	Q0275	810 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YKL065W-A	YKL065W-A	222 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YKR070W	YKR070W	1059 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	PAU23	YLR037C	375 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YLR339C	YLR339C	552 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	HAT1	YPL001W	1125 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	LTP1	YPR073C	486 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	UBP8	YMR223W	1416 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	ILS1	YBL076C	3219 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	GYL1	YMR192W	2163 nt		3.44	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	BMS1	YPL217C	3552 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	MIT1	YEL007W	2001 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	FUN30	YAL019W	3396 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	RPL13A	YDL082W	600 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	AI3	Q0060	1248 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	SMX2	YFL017W-A	234 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	USE1	YGL098W	738 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YGL242C	YGL242C	546 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YAL066W	YAL066W	309 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	RPL6A	YML073C	531 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	TSR4	YOL022C	1227 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	SAS5	YOR213C	747 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YOR366W	YOR366W	354 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	HBT1	YDL223C	3141 nt		3.43	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	MPS1	YDL028C	2295 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YCR100C	YCR100C	951 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YPD1	YDL235C	504 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	RPN9	YDR427W	1182 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	RFA3	YJL173C	369 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	SUI2	YJR007W	915 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YNL109W	YNL109W	546 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	SGT1	YOR057W	1188 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	PFY1	YOR122C	381 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	BTS1	YPL069C	1008 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	CUP9	YPL177C	921 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	RPL36B	YPL249C-A	303 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	GCN1	YGL195W	8019 nt		3.42	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	CHS2	YBR038W	2892 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	RCY1	YJL204C	2523 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	HSE1	YHL002W	1359 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	SIZ1	YDR409W	2715 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YDL050C	YDL050C	372 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	TVP15	YDR100W	432 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	PUG1	YER185W	912 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	COG7	YGL005C	840 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	RPB8	YOR224C	441 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YPL276W	YPL276W	438 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YCG1	YDR325W	3108 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	TPO5	YKL174C	1857 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	SAD1	YFR005C	1347 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YEL025C	YEL025C	3567 nt		3.41	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	XRN1	YGL173C	4587 nt		3.4	□□□□□ -1.86
SYF1	Q04048	POL4	YCR014C	1749 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	GUK1	YDR454C	564 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	SSN8	YNL025C	972 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	YOL106W	YOL106W	354 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	YBR116C	YBR116C	528 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	YNL011C	YNL011C	1335 nt		3.4	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	MUS81	YDR386W	1899 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	MNT3	YIL014W	1893 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	IOC3	YFR013W	2364 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	YFH7	YFR007W	1062 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	YFR057W	YFR057W	456 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	YGL230C	YGL230C	444 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	PET54	YGR222W	882 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	SVP26	YHR181W	687 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	DLS1	YJL065C	504 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	YLL037W	YLL037W	381 nt		3.39	□□□□□ -1.87
SYF1	Q04048	RPL6B	YLR448W	531 nt		3.39	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.2 ms