Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNC4Q03721 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNC4Q03721 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms