Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB1Q02641 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB1Q02641 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms