Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDR2Q01850 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDR2Q01850 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms