Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE1BQ01064 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms