Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MDM2Q00987 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MDM2Q00987 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms