Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK17Q00537 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK17Q00537 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms