Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK16Q00536 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK16Q00536 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK16Q00536 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CDK16Q00536 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK16Q00536 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CDK16Q00536 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CDK16Q00536 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK16Q00536 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms