Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2BQ00403 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2BQ00403 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms