Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFAMQ00059 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms