Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXO4P98177 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXO4P98177 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms