Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAE1P78406 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAE1P78406 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAE1P78406 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RAE1P78406 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
RAE1P78406 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAE1P78406 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAE1P78406 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAE1P78406 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAE1P78406 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAE1P78406 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAE1P78406 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAE1P78406 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAE1P78406 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms