Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNRPNP63162 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNRPNP63162 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNRPNP63162 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms