Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1AP62820 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1AP62820 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1AP62820 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1AP62820 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB1AP62820 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB1AP62820 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms