Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNRPD3P62318 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNRPD3P62318 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms