Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB25P57735 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB25P57735 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB25P57735 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB25P57735 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB25P57735 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB25P57735 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB25P57735 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB25P57735 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB25P57735 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB25P57735 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB25P57735 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms