Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLF3P57682 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLF3P57682 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLF3P57682 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLF3P57682 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLF3P57682 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms