Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL23P55773 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL23P55773 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL23P55773 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL23P55773 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL23P55773 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL23P55773 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL23P55773 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCL23P55773 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL23P55773 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL23P55773 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL23P55773 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCL23P55773 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL23P55773 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL23P55773 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL23P55773 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL23P55773 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL23P55773 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL23P55773 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL23P55773 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL23P55773 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL23P55773 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL23P55773 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL23P55773 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL23P55773 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL23P55773 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL23P55773 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL23P55773 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL23P55773 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL23P55773 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL23P55773 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL23P55773 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL23P55773 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL23P55773 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL23P55773 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms