Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFDNP55196 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFDNP55196 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AFDNP55196 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AFDNP55196 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFDNP55196 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFDNP55196 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFDNP55196 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFDNP55196 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFDNP55196 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFDNP55196 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AFDNP55196 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFDNP55196 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFDNP55196 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFDNP55196 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFDNP55196 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
AFDNP55196 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFDNP55196 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFDNP55196 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFDNP55196 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
AFDNP55196 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AFDNP55196 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AFDNP55196 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFDNP55196 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFDNP55196 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFDNP55196 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFDNP55196 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFDNP55196 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFDNP55196 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFDNP55196 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFDNP55196 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AFDNP55196 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AFDNP55196 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFDNP55196 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFDNP55196 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
AFDNP55196 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFDNP55196 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFDNP55196 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFDNP55196 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AFDNP55196 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AFDNP55196 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms