Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKAP1LP55160 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKAP1LP55160 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms