Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB3P54284 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms