Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN1P54253 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN1P54253 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms