Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	SPR2	YOR214C	711 nt		3.14	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	SRL4	YPL033C	846 nt		3.14	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RPL1A	YPL220W	654 nt		3.14	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	APM3	YBR288C	1452 nt		3.14	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	DBP7	YKR024C	2229 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	VAB2	YEL005C	849 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YFL015C	YFL015C	495 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	COX18	YGR062C	951 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RPL22A	YLR061W	366 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	SRL1	YOR247W	633 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	INP52	YNL106C	3552 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	APC5	YOR249C	2058 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	CIN8	YEL061C	3003 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	TRM82	YDR165W	1335 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	DYN1	YKR054C	12279 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	NGG1	YDR176W	2109 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	SNT1	YCR033W	3681 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	VBA4	YDR119W	2307 nt		3.13	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YLR278C	YLR278C	4026 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	ARF1	YDL192W	546 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	MTC3	YGL226W	372 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	SGN1	YIR001C	753 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	MBR1	YKL093W	1020 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YLR217W	YLR217W	324 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	FAR3	YMR052W	615 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YSF3	YNL138W-A	258 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RFC3	YNL290W	1023 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	DPB3	YBR278W	606 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	BPT1	YLL015W	4680 nt		3.12	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	VAS1	YGR094W	3315 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RAX2	YLR084C	3663 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	PRP31	YGR091W	1485 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	ARP5	YNL059C	2268 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	DUN1	YDL101C	1542 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YEL075C	YEL075C	369 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YHL044W	YHL044W	708 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YJL175W	YJL175W	513 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	IME1	YJR094C	1083 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RCE1	YMR274C	948 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YNL303W	YNL303W	348 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	APD1	YBR151W	951 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YBP2	YGL060W	1926 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	BNA4	YBL098W	1383 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	PSP1	YDR505C	2526 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	FUN30	YAL019W	3396 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	MYO5	YMR109W	3660 nt		3.11	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	NRG1	YDR043C	696 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	UBC13	YDR092W	462 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YDR203W	YDR203W	318 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	PEF1	YGR058W	1008 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	GOS1	YHL031C	672 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YJL114W	YJL114W	681 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YPT52	YKR014C	705 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	NBP1	YLR457C	960 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	TUM1	YOR251C	915 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RRG7	YOR305W	729 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RPL20B	YOR312C	519 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	ARL1	YBR164C	552 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	POP7	YBR167C	423 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	SPO14	YKR031C	5052 nt		3.1	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RAD18	YCR066W	1464 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	URK1	YNR012W	1506 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	PEX6	YNL329C	3093 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	ITC1	YGL133W	3795 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	VMA5	YKL080W	1179 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YKL115C	YKL115C	393 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RNH203	YLR154C	333 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	HUT1	YPL244C	1020 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	RXT2	YBR095C	1293 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YDR170W-A	YDR170W-A	1323 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	PCI8	YIL071C	1335 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YBL005W-A	YBL005W-A	1323 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YMR046C	YMR046C	1323 nt		3.09	□□□□□ -1.91
DSL1	P53847	YLR108C	YLR108C	1458 nt		3.09	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SEC7	YDR170C	6030 nt		3.09	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	AEP1	YMR064W	1557 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	NET1	YJL076W	3570 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	SMT3	YDR510W	306 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YIL175W	YIL175W	318 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YJL222W-B	YJL222W-B	138 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	RPA12	YJR063W	378 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	CAP1	YKL007W	807 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YKL156C-A	YKL156C-A	117 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	RPC37	YKR025W	849 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YLR400W	YLR400W	474 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YLR416C	YLR416C	399 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	RPL6B	YLR448W	531 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	YMR294W-A	YMR294W-A	360 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	TSR4	YOL022C	1227 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	HHF1	YBR009C	312 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	ESC2	YDR363W	1371 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	ERT1	YBR239C	1590 nt		3.08	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	CYR1	YJL005W	6081 nt		3.07	□□□□□ -1.92
DSL1	P53847	CHO2	YGR157W	2610 nt		3.07	□□□□□ -1.92

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