Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms