Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2A2P52657 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2A2P52657 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms