Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK4P51957 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK4P51957 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK4P51957 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK4P51957 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK4P51957 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK4P51957 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK4P51957 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEK4P51957 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEK4P51957 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEK4P51957 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEK4P51957 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEK4P51957 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEK4P51957 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEK4P51957 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms