Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFF1P51825 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFF1P51825 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFF1P51825 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AFF1P51825 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFF1P51825 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFF1P51825 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AFF1P51825 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AFF1P51825 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AFF1P51825 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFF1P51825 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFF1P51825 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFF1P51825 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFF1P51825 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFF1P51825 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms